ННІБЦІ здійснює підготовку здобувачів вищої освіти за спеціальностями:
перший (бакалаврський) рівень
101 Екологія
183 Технології захисту навколишнього середовища
192 Будівництво та цивільна інженерія
(освітні програми "Міське будівництво та господарство"
"Промислове та цивільне будівництво",
"Цивільна інженерія (проф. спрямування Водопостачання та водовідведення, Теплогазопостачання і вентиляція")
193 Геодезія та землеустрій (освітня програма " Геодезія, картографія та землеустрій")
194 Гідротехнічне будівництво, водна інженерія та водні технології
другий (магістерський) рівень
101 Екологія (освітня програма "Екологія міст")
183 Технології захисту навколишнього середовища
192 Будівництво та цивільна інженерія
(освітні програми "Міське будівництво та господарство"
"Цивільна інженерія (професійні спрямування "Водопостачання та водовідведення", "Теплогазопостачання і вентиляція")
"Промислове та цивільне будівництво")
194 Гідротехнічне будівництво, водна інженерія та водні технології
263 Цивільна безпека (освітня програма " Охорона праці")
освітньо-науковий рівень